Mit der Zeit setzen sich an den Fliesenfugen Staub, Schimmel und sonstiger Schmutz an, die unschöne schwarze Streifen und Grauschleier hinterlassen. Diese Entwicklungen machen regelmäßige Reinigungen bzw. Sanierungen notwendig.
Vor dem Erneuern der Fugen steht eine gründliche Reinigung. Im Fachhandel sind entsprechende Reinigungsmittel erhältlich. Hierbei ist jedoch Vorischt geboten: Schmutz wird durch die Reinigungsmittel entfernt, nicht jedoch Schimmel. Bei lediglich leichtem Pilzbefall hilft eventuell Essigwasser, aber bei großflächigerem Schimmel ist ein Schimmelentferner vonnöten. Vor dem Kauf und der Anwendung sollte man sich jedoch über die Inhaltsstoffe informieren. Allzu oft erfordern die enthaltenen Chemikalien besondere Vorsichtsmaßnahmen.
Nach der Reinigung kann mit dem Erneuern der Fugen begonnen werden. Einerseits gibt es spezielle Fugenmarker, mit denen man die Fugen nachzeichnen kann. Wie ein gewöhnlicher Textmarker wird dieser zunächst geschüttelt, und dann wie ein Stift über die Zwischenspalten der Fliesen gezogen. In der Regel ist er in einer Breite von 2-4 Millimeter und nur in der Farbe weiß erhältlich. Er verhindert den Pilzbefall nicht; kann ihn jedoch hinauszögern.
Fugenfarben werden mit dem Schwamm aufgetragen. Anders als der Stift gibt es sie in vielen verschiedenen Fugenbreiten und Farben. Auch die Farbe wirkt lediglich hemmend auf den Pilzbefall.